隨著醫藥C牌照（企業面對消費者）井噴，醫藥B2C市場已成為紅海，醫藥電商開始探索B2B市場。艾瑞網日前發布報告顯示，2015年上半年B2B占銷售額比重為90%，是整個醫藥電商中的銷售主體，但集中在政府主導的B2B采購平臺和少數藥企手中。誘人的市場份額讓壹藥網等企業加緊對B2B市場的探索。
醫藥電商牌照的井噴和政策利好、資本關注的大環境讓醫藥B2C電商飛速發展。報告顯示，從2005年京衛大藥房獲得第一張醫藥電商牌照至今，我國獲得醫藥網上交易資格證書的企業為442家，絕大多數為營運B2C業務的C照，網上藥店329家。現階段獲得網上交易資格證書的企業和中國網上藥店數量不斷增加，在經過初期的快速增長后，現階段增速放緩，目前行業內參與者眾多，市場競爭加劇。
在這一背景下，不少企業希望進入B2B市場，而醫藥B2B市場由寡頭瓜分。目前，中國醫藥、上海醫藥和華潤醫藥三家國企背景的醫藥企業瓜分了大部分市場，三者年收入均在700億元以上，中國醫藥集團超過1000億元。不同于B2C市場，“電商潮”也沒能讓醫藥B2B市場產生實質改變。業內專家認為，醫藥B2B電商區域性強，難以滿足跨地區的采購需求，在商業模式不成熟的情況下也難以與傳統企業抗衡。
巨頭入局或讓這一現狀有所改變。今年9月，天貓醫藥館獲互聯網藥品交易A證，擁有了為藥品生產企業、藥品經營企業和醫療機構之間的互聯網藥品交易提供服務的資格。重掌壹藥網的于剛日前也表示將探索B2B市場，醫藥B2B電商必須以現代信息化醫藥物流配送體系為支撐，為控制成本，物流方面將與第三方合作。
